都是地源热泵，冷热源均是地球浅表，都是利用地球的尚未开发的可恢复的清洁能源。能效比基本上一样。
相同点：都是地源热泵，冷热源均是地球浅表，都是利用地球的尚未开发的可恢复的清洁能源。能效比基本上一样。
不同点：
1、政府支持度：
a、 土壤源热泵：明确支持和大力推广，有些地区已经实施每平米给予不同程度50-100元的补贴（北京，上海，浙江，山东某些地区等）。
b、
水源热泵：未明确支持和大力推广，态度不明朗，有些地区明令禁止（天津，上海等）。
2、 环保生态环境：
a、 土壤源热泵：真正环保，不抽取地下水，对环境无任何负面影响。
b、水源热泵：会对地下水资源、对周边环境造成了一定程度的破坏，实际上把对大气的污染转移到地下水水中，土壤中。虽然理论上抽取的地下水将回灌到地下水层，但目前国内抽取的地下水真正做到全部回灌的少之又少，回灌难落实，采水量大于回灌量，造成地下水位下降，严重时将导致地质层发生变化，地面沉降。另外，对水资源存在物理、化学、生物污染，怎样保证地下水层不受污染也是一个棘手的问题。（武汉汤逊湖地区做的地下水源热泵空调，已经停用，没地下水了！北京地区使用水源热泵机组的地区,由于长期使用地下水,倒至地表层下陷。）
3、适应性；
a、 土壤源热泵：运行稳定，免维护。与地下有无水没有任何关系。
b、 水源热泵：一旦地下水量不能满足机组要求，系统将瘫痪。而且在使用过程中，一般3-5年需对水井、板式换热器进行定期维护。
4、寿命；
a、土壤源热泵：土壤源热泵地埋管换热器由于周围土壤无变化，故其寿命取决于换热器本身，可使用50年。
B、水源热泵：主要取决于水井的寿命，达到设计出水的运行时间一般为3-5年。
5、运行费用：（包括设备运行费用和维护检修费用）
a、土壤源热泵：土壤换热器免维护。设备维护费用为0。
b、水源热泵：水井、板式换热器需定期（一般为3-5年）维护，费用不菲，需交纳水资源费。
6、运行稳定性：
a、土壤源热泵：由于其与土壤进行热交换，运行稳定性非常好。
b、水源热泵；地下水量随着运行时间的延长，不一定能满足机组要求，一旦地下水资源溃乏，系统随之瘫痪。
7、运行维护：
a、土壤源热泵：土壤换热器50年内免维护。
B、水源热泵：板式换热器需定期维护；水井需养井，由于泥砂堵塞，回灌量逐年递减，井的寿命最多3～5年。
8、初投资：
土壤源热泵比水源热泵初投资略大。
9、使用风险性；
a、水源热泵：风险性很大，地下水量的大小，国家对地下水源的使用政策都是不确定因素。谁也无法保证可长期利用地下水源。
b、
土壤源热泵：无任何风险。国家重点推广，扶持。
10、能效比；水源热泵系统采用板式换热器间接换热，虽然保护了机组但机组的能效比约降低5%,和土壤源热泵相当。
有关水源热泵的问题：
1、水源热泵有它的优点,也有很多不足之处,它的应用受到地质条件的制约：水质、水量、地下水的稳定性等。地下水源热泵大量应用暴露出了很多问题，最为典型的是回灌井失效，回灌井堵塞和溢出是大多数地下水源热泵都会出现的问题。
2、水源热泵由于它是利用地下热能这一可再生能源，最近几年受到了人们越来越多的关注。 然而，就在这项技术逐步被人们所认识的时候，我国一些地区却纷纷出现了地下水由于严重开采，造成地下水位下降，严重的已导致地质层发生变化。
3、国外如美国、欧州主要研究和应用的地源热泵系统以及我国研究和推广的重点均是土壤源热泵系统而不是水源热泵。在美国地源热泵，是通过采集土壤、江河湖水中的热量或冷量，多采用密闭式的系统，一般设计时，不与地下水资源直接接触。很少进行地下水的抽取。
在中国可能理论上可以达到环保，但是实际在使用过程中完全会发生变化，情况如下：
1）、系统容易被泥砂堵塞
2）、水抽几年就没了
3）、存在物理、化学、生物污染等地下水污染
4）、无法100%回灌，回灌难落实，采水量大于回灌量，水资源浪费
4、应用水源热泵系统受到许多条件限制：一是这种系统需要有丰富和稳定的地下水资源作为先决条件。在实际工程中，地下水源系统的经济性与地下水层的深度有着很大的关系，如果地下水位较低，不仅成井的费用增加，运行中水泵的耗电量也会大大提高。二是地下水是否充分回灌问题。虽然理论上抽取的地下水将回灌到地下水层，但目前国内抽取的地下水真正做到全部回灌的少之又少。即使能够把抽取的地下水全部回灌，怎样保证地下水层不受污染也是一个棘手的问题。三是使用的经济性问题。由于水源热泵系统实际消耗的仍是电能，加上需要支付的地热开采费、水源抽取费、排放费等，综合起来运行成本并不低。因此地下水源热泵系统具有高投入、高风险性，投资者在决定使用时一定要因地制宜、慎之又慎。
5、地下水资源在某种程度上是国家的一种战略物资，而且一些水文地质界的专家对当前地下水源热泵的发展也持保留意见，因此，对于在我国大面积推广这种系统应采取慎重的态度。相关部门应加强对地热资源的管理和保护，对地热资源的开采应严格把关和监控，以保护我们赖以生存的、越来越宝贵的地下水资源，保护家园，造福后人。
6、地下水属于优质淡水资源，储藏量有限，大规模、过量开采地下水，可能产生地质环境问题和地质灾害，破坏地下水环境和生态环境等，其影响深远甚至无法弥补。
7、武汉地区虽地下水量丰富，但1999年和1998年相比，全区地下水位呈下降趋势，下降幅度在0.14-1.11米之间。多年以后，地下水位到底会下降多少，是个未知数。水源热泵是否能长期稳定的运行，谁也无法保证。而且有资料表明，上水源热泵系统的地方，地面沉陷每年约为0.5-1cm（比如武汉香榭里花园）。多年以后，会危及建筑物的安全。
8、目前中国的地下水资源形式已十分严峻，国土资源部的调查标明，东北、华北、和西北地区地下水位呈总体下降趋势，华东、中南和西南有升有降，黄、淮海地区在区域上呈不断下降趋势，河北与河南北部地区以及山东黄河以西的地下水下降漏斗已经连成一片，从而形成一个包括北京、天津在内的地下水降落的大漏斗，总面积已经超过4万平方公里。天津唐沽地下水过量开采，导致海水渗透进去，对生态造成严重破坏，西安由于地下水过量开采，导致大雁塔倾斜近1m，并且形成13条纵、横向裂缝，长达50Km,钟鼓楼下陷135mm,专家呼吁，近年来大量开采地下水而诱发的地面沉降，海水入浸、突发性岩溶坍塌等一系列环境地质问题，应当引起高度重视。专家强调指出，大漏斗的形成并不仅仅标明我们仍在超采地下水，它还标明水危机意识还没有真正深入人心，为了维持今天的发展，人们一直在喝“子孙水”，长此以往，深层地下水将会喝光、用光，我们将来的可持续发展就成了“无本之木”，这才是影响千秋万代的大事情。
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